负责南四环流域生态环境监管以及省南水北调工程项目区生态环境保护工作，配合做好南四湖流域水生态环境监管执法工作。拟订全市水生态环境政策、规划、制度并组织实施。负责全市地表水生态环境监督管理工作，拟订全市水功能区划，开展水生态环境承载力评估。拟订并监督实施全市重点流域污染防治规划计划。组织实施跨界河流断面水质考核。监督管理全市饮用水水源地生态环境保护工作，负责入河排污口设置管理。